保卫萝卜2挑战模式是游戏中的高难度玩法，其核心特点在于怪物血量大幅提升、萝卜生命值不自动恢复，以及炮塔随机刷新机制。该模式下玩家需从系统提供的三个随机炮塔中选择一个进行建造，每关通常有5次刷新机会（第1、3、5、9、15波），部分关卡如第83和104关可刷新6次。不同于普通模式，挑战模式通关后萝卜被啃食的血量会延续至下一关，若全部生命耗尽则需从存档点重新开始，增加了策略容错要求。
挑战模式的进度节点设计具有规律性，第14关为首个BOSS关卡兼存档点，第18关为宝箱奖励关，后续以交替形式延续。存档点激活需消耗糖果道具，通过每日签到或挑战模式获取。已开启的宝箱无法重复获取，即使关卡失败重打也不会重置奖励。这种设定要求玩家在资源管理和关卡规划上更谨慎，尤其需关注急救包的使用技巧——当萝卜濒危时可暂停重开或通过前关刷取急救包恢复生命，但满血状态下无法使用。
炮塔组合策略是挑战模式的核心战术。由于怪物血量极厚，主流打法分为火力压制与雪花永冻两种流派。磁铁炮塔因其刷钱能力成为经济核心，瓶子炮虽单体伤害低但能提升周围塔20%攻击力，月亮与减速风扇是优选减速塔，而雪花塔通过2.5秒定身效果可实现怪物走停循环。主力输出推荐飞机、火箭、魔法球等范围伤害塔，避免选择汽油瓶、多重箭等低效塔种。太阳+飞机+月亮、太阳+月亮+磁铁+雪花等组合能较好应对多数关卡。
前期优先用太阳、章鱼等炮塔快速清理道具获取经济，中后期根据地形选择集中火力或分散布防。对于三无关卡（无减速、无经济、无强力塔），必须依赖磁铁刷钱配合雪花控怪。最后一波怪物出现时，可出售边缘炮塔集中火力，同时注意部分隐藏炮塔的触发条件，如第16关需优先击破大宝箱获取四门火箭炮。
该模式最终评价仅与萝卜是否被啃食相关，满血通关可获得金色萝卜徽章。虽然难度较高，但通过合理利用暂停重开机制、急救包补给及雪花控怪技巧，能显著提升通关效率。建议参考第31关甲壳虫陷阱、第43关船锚炸弹优先等具体关卡策略，逐步适应挑战模式的独特节奏。
